Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
BckdkO55028 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
BckdkO55028 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BckdkO55028 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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