Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms