Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn5O54942 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn5O54942 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms