Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrxO54751 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrxO54751 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrxO54751 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms