Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bnc1O35914 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms