Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp100O35892 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms