Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc27a2O35488 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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