Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NmiO35309 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NmiO35309 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NmiO35309 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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NmiO35309 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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NmiO35309 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NmiO35309 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NmiO35309 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NmiO35309 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmiO35309 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms