Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms