Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm2035J3QP87 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm2035J3QP87 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm2035J3QP87 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm2035J3QP87 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm2035J3QP87 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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