Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5108J3QP01 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5108J3QP01 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5108J3QP01 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms