Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20918J3QN17 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20918J3QN17 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms