Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm3336J3QMQ6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm3336J3QMQ6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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