Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20834J3QM72 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms