Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AK157302I3ITR1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms