Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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