Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Srp72F8VQC1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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