Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NpcdF8VQB8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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