Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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