Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21974F6W3F3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21974F6W3F3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms