Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx60E9PZQ1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms