Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms