Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms