Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tgfbr3lD3YZZ2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tgfbr3lD3YZZ2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tgfbr3lD3YZZ2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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