Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms