Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms