Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms