Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms