Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms