Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms