Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssxb8B1AY40 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssxb8B1AY40 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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