Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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