Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms