Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms