Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Prdm16A2A935 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prdm16A2A935 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms