Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms