Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms