Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrit3W8DXL4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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