Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms