Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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