Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn15Q9Z0S5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms