Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms