Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stxbp4Q9WV89 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms