Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AmfrQ9R049 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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AmfrQ9R049 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmfrQ9R049 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmfrQ9R049 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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AmfrQ9R049 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms