Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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