Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Col4a4Q9QZR9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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