Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms