Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hacd1Q9QY80 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms