Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms