Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dkk3Q9QUN9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms